肌营养不良

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TUhjnbcbe - 2021/4/26 12:58:00
串联重复序列,又称卫星DNA,占人类基因组约10%,包含短串联重复(STR),可变串联重复(VNTR)与长串联重复等。研究发现,串联重复序列与50多种神经系统疾病密切相关,短串联重复相关疾病,如亨廷顿舞蹈症、脆性X综合征等;可变串联重复相关疾病,如遗传性小管间质肾病等;长串联重复相关疾病,如面肩肱型肌营养不良症等。随着Nanopore、PacBio等长读长测序技术的发展,又有多种疾病被发现与串联重复相关。希望组医学团队在Nanopore、PacBio测序、数据分析方面有着全面、深刻的认识,已联合国内外多家科研单位对近个人类基因组样本进行了测序,在提取、建库、测序、生信分析等各个环节积累了大量的宝贵经验,开发了repeatHMM1软件用于确定STR的重复数目,在连锁定位区域内,成功鉴定出多个STR致病基因。年9月7日,JournalofMedicalGenetics报道希望组医学团医院合作发现SAMD12基因内含子区域TTTCA、TTTTA重复扩张与良性成人家族性肌阵挛性癫痫有关2。本文由“编辑器”提供技术支持年7月3日,TheAmericanJournalofHumanGenetics报道希望组医学团医院合作发现NOTCH2NLC基因的5’UTR区域GGC重复扩张与神经元核内包涵体病、阿尔茨海默病、帕金森综合征等疾病有关3。本文由“编辑器”提供技术支持

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年8月14日,JournalofMedicalGenetics报道希望组医学团医院合作发现NOTCH2NLC基因的5’UTR区域GGC重复扩张与神经元核内包涵体病有关4。本文由“编辑器”提供技术支持年1月1日,Brain报道希望组医学团医院合作发现NOTCH2NLC基因的5’UTR区域GGC重复扩张与特发性震颤有关5。本文由“编辑器”提供技术支持

此外,在可变串联重复与长串联重复领域,希望组医学团队同样取得重大突破。医院神经内科合作,开展了基于Bionano光学图谱技术检测面肩肱型肌营养不良症(FSHD)相关的长串联重复D4Z4重复数目的研究,文章已发表于JournalofMedicalGenetics6;与医院产前诊断中心合作,在PrenatalDiagnosis发表了关于FSHD的产前诊断技术的文章7;医院合作,开展了关于遗传性肾小管间质肾病MUC1基因可变串联重复检测的研究8。

在串联重复扩张检测方面,希望组医学团队参与发表署名文章8篇,其中不乏AJHG、Brain等高水平文章,可谓硕果累累。虽然基本都是同时进行的相关研究,但我们错失了率先发现新的致病基因机会,日本团队抢先在NatureGenetics发表了3篇相关文章。1.年3月5日,NatureGenetics报道日本团队发现SAMD12基因内含子区域TTTCA、TTTTA重复扩张与良性成人家族性肌阵挛性癫痫有关9;2.年7月22日,NatureGenetics报道日本团队发现NOTCH2NLC基因的5’UTR区域GGC重复扩张与神经元核内包涵体病有关10;3.年7月22日,NatureGenetics报道日本团队发现NOTCH2NLC、LOC/NUTM2B-AS1、LRP12等基因的5’UTR区域发现GGC重复扩张分别与神经元核内包涵体病、眼咽肌病伴白质脑病、眼咽远端型肌病等疾病有关11。

创新、突破、引领是希望组的核心价值观。希望组在串联重复扩张检测方面的研发成果接踵而至,近日,希望组医学团医院、医院神经内科科研团队精诚合作,攻坚克难,优化技术方案,对8例眼咽远端型肌病样本(5例家系样本和3例散发样本)进行Nanopore全基因组测序分析,成功确定了新的致病基因GIPC1在5’UTR区域存在GGC重复扩张12。该研究成果年5月14日发表在TheAmericanJournalofHumanGenetics。

确定多个已知串联重复,长读长测序平台风头正盛;发现新基因的串联重复,希望组医学团队砥砺前行!有平台,有技术,有热情,有信心,我们距离NatureGenetics,差的就是您手中的样本!希望组医学寻求战略合作,我们一起勇攀科研高峰,探寻基因奥秘…

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