1、Science:报道两种新的单细胞测序方法,有助于更全面了解细胞类型及功能
《Science》,报道了两种新的单细胞测序方法。其中一种,哈佛大学研究人员结合Hi-C侧重于分析基因组结构的Dip-C,将基于转座子的全基因组扩增方法与用于输入染色体单倍型的算法相结合。该方法首次成功重建了人类二倍体单细胞基因组3D结构,使其分辨率达到20kb。研究人员对淋巴母细胞系细胞和全血细胞进行研究,使用流式细胞术分离细胞,并使用略微修改版本的Hi-C染色质构象方法,然后对每个细胞进行了基于多重转座子的全基因组扩增方法随后进行测序,重建了单个二倍体人类细胞基因组结构,定位了细胞核中特定单核苷酸变异和拷贝数变异;第二种,华盛顿大学等研究人员合作开发一种单细胞方法sci-CAR,基于组合索引进行联合检测,将RNA测序与染色质可及性方法ATAC-seq相结合。比较染色质可及性和基因表达的时间动态特征。两个研究团队表明,分析单细胞水平基因表达之外的其他特征将有助于更全面了解各种细胞类型及其功能。